Seberapa besar penurunan toksisitas Omicron? Berbagai studi di dunia nyata mengungkapkannya.

“Virulensi Omicron mendekati virulensi influenza musiman” dan “Omicron secara signifikan kurang patogenik daripada Delta”. …… Baru-baru ini, banyak berita tentang virulensi strain mutan mahkota baru Omicron telah menyebar di internet.

Memang, sejak kemunculan strain mutan Omicron pada November 2021 dan prevalensinya secara global, penelitian dan diskusi tentang virulensi dan penularan terus berlanjut tanpa henti. Bagaimana profil virulensi Omicron saat ini? Apa yang dikatakan penelitian tentang hal itu?

Berbagai studi laboratorium: Omicron kurang ganas
Bahkan, sejak Januari 2022, sebuah studi dari Fakultas Kedokteran Li Ka Shing Universitas Hong Kong menemukan bahwa Omicron (B.1.1.529) mungkin kurang patogen dibandingkan dengan strain asli dan strain mutan lainnya.
Ditemukan bahwa strain mutan Omicron tidak efisien dalam menggunakan protease serin transmembran (TMPRSS2), sementara TMPRSS2 dapat memfasilitasi invasi virus ke sel inang dengan membelah protein spike dari virus corona baru. Pada saat yang sama, para peneliti mengamati bahwa replikasi Omicron berkurang secara signifikan pada lini sel manusia Calu3 dan Caco2.

Sumber gambar: internet

Pada model tikus k18-hACE2, replikasi Omicron berkurang di saluran pernapasan atas dan bawah tikus dibandingkan dengan strain asli dan mutan Delta, dan patologi paru-parunya kurang parah, sementara infeksi Omicron menyebabkan penurunan berat badan dan kematian yang lebih sedikit daripada strain asli dan mutan Alpha, Beta, dan Delta.
Oleh karena itu, para peneliti menyimpulkan bahwa replikasi dan patogenisitas Omicron berkurang pada tikus.

Sumber gambar: internet

Pada 16 Mei 2022, Nature menerbitkan sebuah makalah karya Yoshihiro Kawaoka, seorang ahli virologi terkemuka dari Universitas Tokyo dan Universitas Wisconsin, yang untuk pertama kalinya mengkonfirmasi dalam model hewan bahwa Omicron BA.2 memang kurang virulen dibandingkan strain asli sebelumnya.

Para peneliti memilih virus BA.2 hidup yang diisolasi di Jepang untuk menginfeksi tikus k18-hACE2 dan hamster dan menemukan bahwa, setelah infeksi dengan dosis virus yang sama, tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki titer virus yang secara signifikan lebih rendah di paru-paru dan hidung dibandingkan dengan infeksi strain New Crown asli (p<0,0001).

Hasil standar emas ini menegaskan bahwa Omicron memang kurang virulen dibandingkan tipe liar aslinya. Sebaliknya, tidak ada perbedaan signifikan dalam titer virus di paru-paru dan hidung model hewan setelah infeksi BA.2 dan BA.1.

Sumber gambar: internet

Pengujian kadar virus PCR menunjukkan bahwa tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki kadar virus yang lebih rendah di paru-paru dan hidung dibandingkan dengan strain New Crown asli, terutama di paru-paru (p<0,0001).

Mirip dengan hasil pada tikus, titer virus yang terdeteksi di hidung dan paru-paru hamster yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 lebih rendah daripada strain asli setelah 'inokulasi' dengan dosis virus yang sama, terutama di paru-paru, dan sedikit lebih rendah di hidung hamster yang terinfeksi BA.2 daripada BA.1 – bahkan, setengah dari hamster yang terinfeksi BA.2 tidak mengalami infeksi paru-paru.

Lebih lanjut ditemukan bahwa strain asli, BA.2 dan BA.1, tidak memiliki netralisasi silang serum setelah infeksi – konsisten dengan apa yang telah diamati pada manusia di dunia nyata ketika terinfeksi dengan mutan virus corona baru yang berbeda.

Sumber gambar: internet

Data dunia nyata: Omicron cenderung lebih kecil kemungkinannya menyebabkan penyakit serius.

Beberapa penelitian di atas telah menjelaskan penurunan virulensi Omicron pada model hewan laboratorium, tetapi apakah hal yang sama berlaku di dunia nyata?

Pada tanggal 7 Juni 2022, WHO menerbitkan sebuah laporan yang menilai perbedaan tingkat keparahan orang yang terinfeksi selama epidemi Omicron (B.1.1.529) dibandingkan dengan pandemi Delta.

Laporan tersebut mencakup 16.749 pasien rawat inap baru dengan penyakit jantung koroner dari seluruh provinsi di Afrika Selatan, termasuk 16.749 dari epidemi Delta (2/8/2021 hingga 3/10/2021) dan 17.693 dari epidemi Omicron (15/11/2021 hingga 16/2/2022). Pasien juga diklasifikasikan sebagai berat, serius, dan tidak serius.

Kritis: telah menerima ventilasi invasif, atau oksigen dan oksigen transnasal aliran tinggi, atau oksigenasi membran ekstrakorporeal (ECMO), atau dirawat di ICU selama rawat inap.
-parah (parah): menerima oksigen selama rawat inap
-Tidak parah: jika tidak satu pun dari kondisi di atas terpenuhi, pasien tidak parah.

Data menunjukkan bahwa pada kelompok Delta, 49,2% dalam kondisi serius, 7,7% dalam kondisi kritis, dan 28% dari semua pasien yang dirawat di rumah sakit yang terinfeksi Delta meninggal, sedangkan pada kelompok Omicron, 28,1% dalam kondisi serius, 3,7% dalam kondisi kritis, dan 15% dari semua pasien yang dirawat di rumah sakit yang terinfeksi Omicron meninggal. Selain itu, rata-rata lama rawat inap adalah 7 hari pada kelompok Delta dibandingkan dengan 6 hari pada kelompok Omicron.

Selain itu, laporan tersebut menganalisis faktor-faktor yang memengaruhi seperti usia, jenis kelamin, status vaksinasi, dan komorbiditas, dan menyimpulkan bahwa Omicron (B.1.1.529) dikaitkan dengan probabilitas yang lebih rendah terhadap penyakit serius dan kritis (95% CI: 0,41 hingga 0,46; p<0,001) dan risiko kematian di rumah sakit yang lebih rendah (95% CI: 0,59 hingga 0,65; p<0,001).

Sumber gambar: internet

Untuk berbagai subtipe Omicron, studi lebih lanjut juga telah menganalisis virulensi mereka secara detail.

Sebuah studi kohort dari New England menganalisis 20.770 kasus Delta, 52.605 kasus Omicron B.1.1.529, dan 29.840 kasus Omicron BA.2, dan menemukan bahwa proporsi kematian adalah 0,7% untuk Delta, 0,4% untuk B.1.1.529, dan 0,3% untuk BA.2. Setelah disesuaikan dengan faktor-faktor pengganggu, studi tersebut menyimpulkan bahwa risiko kematian secara signifikan lebih rendah untuk BA.2 dibandingkan dengan Delta dan B.1.1.529.

Sumber gambar: internet

Studi lain dari Afrika Selatan menilai risiko rawat inap dan risiko hasil yang parah untuk Delta, BA.1, BA.2 dan BA.4/BA.5. Hasilnya menunjukkan bahwa dari 98.710 pasien yang baru terinfeksi yang termasuk dalam analisis, 3825 (3,9%) dirawat di rumah sakit, di mana 1276 (33,4%) mengalami penyakit parah.

Di antara mereka yang terinfeksi dengan mutasi yang berbeda, 57,7% pasien yang terinfeksi Delta mengalami penyakit parah (97/168), dibandingkan dengan 33,7% pasien yang terinfeksi BA.1 (990/2940), 26,2% BA.2 (167/637) dan 27,5% BA.4/BA.5 (22/80). Analisis multivariat menunjukkan bahwa probabilitas mengalami penyakit serius di antara mereka yang terinfeksi Delta > BA.1 > BA.2, sedangkan probabilitas mengalami penyakit serius di antara mereka yang terinfeksi BA.4/BA.5 tidak berbeda secara signifikan dibandingkan dengan BA.2.
Virulensi berkurang, tetapi kewaspadaan tetap diperlukan.

Studi laboratorium dan data nyata dari beberapa negara telah menunjukkan bahwa Omicron dan subtipe-nya kurang virulen dan kurang mungkin menyebabkan penyakit serius dibandingkan strain asli dan strain mutan lainnya.

Namun, sebuah artikel ulasan dalam edisi Januari 2022 The Lancet, berjudul 'Lebih Ringan tetapi Tidak Ringan', mencatat bahwa meskipun infeksi Omicron menyumbang 21% dari penerimaan pasien di rumah sakit pada populasi Afrika Selatan yang lebih muda, proporsi wabah yang menyebabkan penyakit parah kemungkinan akan meningkat pada populasi dengan tingkat infeksi dan tingkat vaksinasi yang berbeda. (Meskipun demikian, pada populasi Afrika Selatan yang umumnya muda ini, 21% pasien rawat inap yang terinfeksi varian omicron SARS-CoV-2 memiliki hasil klinis yang parah, proporsi yang mungkin meningkat dan menyebabkan dampak substansial selama wabah pada populasi dengan demografi yang berbeda dan tingkat kekebalan yang lebih rendah yang diperoleh dari infeksi atau vaksinasi.)

Pada bagian akhir laporan WHO yang disebutkan di atas, tim mencatat bahwa meskipun virulensi strain sebelumnya berkurang, hampir sepertiga pasien Omicron (B.1.1.529) yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah, dan berbagai mutan virus corona baru terus menyebabkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi pada populasi lansia, penderita gangguan imun, atau yang belum divaksinasi. (Kami juga ingin mengingatkan bahwa analisis kami tidak boleh dianggap sebagai pendukung narasi varian 'ringan'. Hampir sepertiga pasien Omicron yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah dan 15% meninggal; angka-angka ini tidak dapat dianggap tidak signifikan……Di antara populasi rentan, yaitu pasien pada usia ekstrem, pada populasi dengan beban komorbiditas tinggi, pada pasien yang lemah, dan di antara mereka yang belum divaksinasi, COVID-19 (semua VOC) terus berkontribusi terhadap morbiditas dan mortalitas yang substansial.)

Data sebelumnya dari Omicron ketika memicu gelombang kelima pandemi di Hong Kong menunjukkan bahwa pada tanggal 4 Mei 2022, terdapat 9.115 kematian dari 1.192.765 kasus baru yang terdiagnosis selama gelombang kelima (tingkat kematian kasar 0,76%) dan tingkat kematian kasar 2,70% untuk orang berusia di atas 60 tahun (sekitar 19,30% dari kelompok usia ini belum divaksinasi).

Sebaliknya, hanya 2% warga Selandia Baru berusia di atas 60 tahun yang belum divaksinasi, yang sangat berkorelasi dengan angka kematian kasar yang rendah yaitu 0,07% untuk epidemi virus corona baru.

Di sisi lain, meskipun seringkali diperdebatkan bahwa Newcastle mungkin akan menjadi penyakit musiman dan endemik di masa depan, ada para ahli akademis yang memiliki pandangan berbeda.

Tiga ilmuwan dari Universitas Oxford dan Pusat Penelitian Gabungan Uni Eropa percaya bahwa tingkat keparahan Omicron yang lebih rendah mungkin hanya kebetulan, dan bahwa evolusi antigenik yang cepat dan berkelanjutan (evolusi antigenik) dapat memunculkan varian baru.

Tidak seperti penghindaran kekebalan dan penularan, yang tunduk pada tekanan evolusi yang kuat, virulensi biasanya hanya merupakan 'produk sampingan' dari evolusi. Virus berevolusi untuk memaksimalkan kemampuan penyebarannya, dan ini juga dapat menyebabkan peningkatan virulensi. Misalnya, dengan meningkatkan muatan virus untuk mempermudah penularan, virus tersebut masih dapat menyebabkan penyakit yang lebih parah.

Tidak hanya itu, tetapi virulensi juga akan menyebabkan kerusakan yang sangat terbatas selama penyebaran virus jika gejala yang ditimbulkan oleh virus tersebut sebagian besar muncul di tahap akhir infeksi – seperti pada kasus virus influenza, HIV, dan virus hepatitis C, untuk menyebutkan beberapa contoh, yang memiliki banyak waktu untuk menyebar sebelum menyebabkan konsekuensi serius.

Sumber gambar: internet

Dalam keadaan seperti itu, mungkin sulit untuk memprediksi tren strain mutan virus corona baru dari virulensi Omicron yang lebih rendah, tetapi kabar baiknya adalah vaksin virus corona baru telah menunjukkan pengurangan risiko penyakit parah dan kematian terhadap semua strain mutan, dan peningkatan agresif tingkat vaksinasi populasi tetap menjadi cara penting untuk memerangi epidemi pada tahap ini.
Ucapan Terima Kasih: Artikel ini telah ditinjau secara profesional oleh Panpan Zhou, PhD, Fakultas Kedokteran Universitas Tsinghua dan Rekan Pascasarjana, Scripps Research Institute, AS.
Reagen antigen Omicron untuk tes mandiri di rumah.