Seberapa besar penurunan toksisitas Omicron? Beberapa studi di dunia nyata mengungkapkan

“Virulensi Omicron mendekati virulensi influenza musiman” dan “Omicron secara signifikan kurang patogenik dibandingkan Delta”. …… Akhir-akhir ini, banyak berita tentang virulensi strain mutan mahkota baru Omicron telah tersebar di internet.

Memang, sejak munculnya strain mutan Omicron pada bulan November 2021 dan prevalensi globalnya, penelitian dan diskusi tentang virulensi dan penularan terus berlanjut tanpa henti. Bagaimana profil virulensi Omicron saat ini? Apa yang dikatakan penelitian tentangnya?

Berbagai penelitian laboratorium: Omicron kurang virulen
Faktanya, pada Januari 2022, sebuah penelitian dari Fakultas Kedokteran Universitas Hong Kong Li Ka Shing menemukan bahwa Omicron (B.1.1.529) mungkin kurang patogen dibandingkan dengan strain asli dan strain mutan lainnya.
Ditemukan bahwa galur mutan Omicron tidak efisien dalam menggunakan protease serin transmembran (TMPRSS2), sementara TMPRSS2 dapat memfasilitasi invasi virus ke sel inang dengan memecah protein lonjakan virus corona baru. Pada saat yang sama, para peneliti mengamati bahwa replikasi Omicron berkurang secara signifikan pada lini sel manusia Calu3 dan Caco2.

Sumber gambar internet

Pada model tikus k18-hACE2, replikasi Omicron berkurang pada saluran pernapasan atas dan bawah tikus dibandingkan dengan strain asli dan mutan Delta, dan patologi paru-parunya kurang parah, sedangkan infeksi Omicron menyebabkan lebih sedikit kehilangan berat badan dan kematian dibandingkan dengan strain asli dan mutan Alpha, Beta, dan Delta.
Oleh karena itu, para peneliti menyimpulkan bahwa replikasi dan patogenisitas Omicron berkurang pada tikus.

Sumber gambar internet

Pada tanggal 16 Mei 2022, Nature menerbitkan sebuah makalah oleh Yoshihiro Kawaoka, seorang ahli virologi terkemuka dari Universitas Tokyo dan Universitas Wisconsin, yang mengonfirmasi untuk pertama kalinya dalam model hewan bahwa Omicron BA.2 memang kurang virulen dibandingkan strain asli sebelumnya.

Para peneliti memilih virus BA.2 hidup yang diisolasi di Jepang untuk menginfeksi tikus dan hamster k18-hACE2 dan menemukan bahwa, setelah infeksi dengan dosis virus yang sama, tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki titer virus yang secara signifikan lebih rendah di paru-paru dan hidung dibandingkan infeksi strain New Crown asli (p<0,0001).

Hasil standar emas ini menegaskan bahwa Omicron memang kurang virulen dibandingkan tipe liar aslinya. Sebaliknya, tidak ada perbedaan signifikan dalam titer virus di paru-paru dan hidung model hewan setelah infeksi BA.2 dan BA.1.

Sumber gambar internet

Pengujian beban virus PCR menunjukkan bahwa tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki beban virus yang lebih rendah di paru-paru dan hidung dibandingkan dengan strain New Crown asli, terutama di paru-paru (p<0,0001).

Mirip dengan hasil pada tikus, titer virus yang terdeteksi di hidung dan paru-paru hamster yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 lebih rendah daripada strain asli setelah 'inokulasi' dengan dosis virus yang sama, terutama di paru-paru, dan sedikit lebih rendah di hidung hamster yang terinfeksi BA.2 daripada BA.1 – faktanya, setengah dari hamster yang terinfeksi BA.2 tidak mengalami infeksi paru-paru.

Lebih lanjut ditemukan bahwa strain asli, BA.2 dan BA.1, tidak memiliki netralisasi silang serum setelah infeksi – konsisten dengan apa yang telah diamati pada manusia di dunia nyata ketika terinfeksi dengan mutan mahkota baru yang berbeda.

Sumber gambar internet

Data dunia nyata: Omicron lebih kecil kemungkinannya menyebabkan penyakit serius

Beberapa penelitian di atas telah menjelaskan berkurangnya virulensi Omicron pada model hewan laboratorium, tetapi apakah hal yang sama berlaku di dunia nyata?

Pada tanggal 7 Juni 2022, WHO menerbitkan laporan yang menilai perbedaan tingkat keparahan orang yang terinfeksi selama epidemi Omicron (B.1.1.529) dibandingkan dengan pandemi Delta.

Laporan tersebut mencakup 16.749 pasien rawat inap koroner baru dari semua provinsi di Afrika Selatan, termasuk 16.749 dari epidemi Delta (2/8/2021 hingga 3/10/2021) dan 17.693 dari epidemi Omicron (15/11/2021 hingga 16/2/2022). Pasien-pasien tersebut juga diklasifikasikan sebagai parah, serius, dan tidak serius.

kritis: telah menerima ventilasi invasif, atau oksigen dan oksigen transnasal aliran tinggi, atau oksigenasi membran ekstrakorporeal (ECMO), atau masuk ke ICU selama rawat inap.
- parah (berat): menerima oksigen selama dirawat di rumah sakit
-tidak parah: jika tidak ada kondisi di atas yang terpenuhi, pasien termasuk dalam kategori tidak parah.

Data menunjukkan bahwa pada kelompok Delta, 49,2% pasien serius, 7,7% kritis dan 28% dari semua pasien Delta yang dirawat di rumah sakit meninggal, sedangkan pada kelompok Omicron, 28,1% pasien serius, 3,7% kritis dan 15% dari semua pasien Omicron yang dirawat di rumah sakit meninggal. Selain itu, lama rawat inap rata-rata adalah 7 hari pada kelompok Delta dibandingkan dengan 6 hari pada kelompok Omicron.

Selain itu, laporan tersebut menganalisis faktor-faktor yang memengaruhi yaitu usia, jenis kelamin, status vaksinasi, dan penyakit penyerta, serta menyimpulkan bahwa Omicron (B.1.1.529) dikaitkan dengan kemungkinan lebih rendah terkena penyakit serius dan kritis (95% CI: 0,41 hingga 0,46; p<0,001) dan risiko lebih rendah terkena kematian di rumah sakit (95% CI: 0,59 hingga 0,65; p<0,001).

Sumber gambar internet

Untuk berbagai subtipe Omicron, penelitian lebih lanjut juga menganalisis virulensinya secara rinci.

Sebuah studi kohort dari New England menganalisis 20.770 kasus Delta, 52.605 kasus Omicron B.1.1.529, dan 29.840 kasus Omicron BA.2, dan menemukan bahwa proporsi kematian adalah 0,7% untuk Delta, 0,4% untuk B.1.1.529, dan 0,3% untuk BA.2. Setelah disesuaikan dengan faktor-faktor pengganggu, studi tersebut menyimpulkan bahwa risiko kematian secara signifikan lebih rendah untuk BA.2 dibandingkan dengan Delta dan B.1.1.529.

Sumber gambar internet

Studi lain dari Afrika Selatan menilai risiko rawat inap dan risiko hasil yang parah untuk Delta, BA.1, BA.2, dan BA.4/BA.5. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 98.710 pasien yang baru terinfeksi yang termasuk dalam analisis, 3.825 (3,9%) dirawat di rumah sakit, di antaranya 1.276 (33,4%) mengalami penyakit parah.

Di antara mereka yang terinfeksi dengan berbagai mutasi, 57,7% pasien yang terinfeksi Delta mengalami penyakit parah (97/168), dibandingkan dengan 33,7% pasien yang terinfeksi BA.1 (990/2940), 26,2% pasien BA.2 (167/637) dan 27,5% pasien BA.4/BA.5 (22/80). Analisis multivariat menunjukkan bahwa kemungkinan terkena penyakit serius di antara mereka yang terinfeksi Delta > BA.1 > BA.2, sedangkan kemungkinan terkena penyakit serius di antara mereka yang terinfeksi BA.4/BA.5 tidak berbeda secara signifikan dibandingkan dengan BA.2.
Virulensi berkurang, namun kewaspadaan tetap diperlukan

Studi laboratorium dan data nyata dari beberapa negara telah menunjukkan bahwa Omicron dan subtipe-nya kurang ganas dan kecil kemungkinannya menyebabkan penyakit serius dibandingkan strain asli dan strain mutan lainnya.

Namun, sebuah artikel ulasan dalam jurnal The Lancet edisi Januari 2022, berjudul 'Lebih ringan tetapi tidak ringan', mencatat bahwa meskipun infeksi Omicron menyumbang 21% dari pasien rawat inap di populasi Afrika Selatan yang lebih muda, proporsi wabah yang menyebabkan penyakit parah cenderung meningkat pada populasi dengan tingkat infeksi dan tingkat vaksinasi yang berbeda. (Meskipun demikian, pada populasi Afrika Selatan yang umumnya muda ini, 21% pasien rawat inap yang terinfeksi varian omicron SARS-CoV-2 mengalami hasil klinis yang parah, proporsi yang mungkin meningkat dan menyebabkan dampak substansial selama wabah pada populasi dengan demografi yang berbeda dan tingkat kekebalan yang lebih rendah yang berasal dari infeksi atau yang berasal dari vaksin.)

Di akhir laporan WHO yang disebutkan di atas, tim mencatat bahwa meskipun virulensi strain sebelumnya berkurang, hampir sepertiga pasien Omicron (B.1.1.529) yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah, dan berbagai mutan mahkota baru terus menyebabkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi pada populasi lanjut usia, yang mengalami gangguan kekebalan tubuh, atau yang tidak divaksinasi. (Kami juga ingin mengingatkan bahwa analisis kami tidak boleh dianggap mendukung narasi varian 'ringan'. Hampir sepertiga pasien Omicron yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah dan 15% meninggal; angka yang tidak dapat diabaikan……Di antara populasi yang rentan, yaitu pasien pada usia yang ekstrem, pada populasi dengan beban komorbiditas yang tinggi, pada pasien yang lemah, dan di antara yang tidak divaksinasi, COVID-19 (semua VOC) terus berkontribusi terhadap morbiditas dan mortalitas yang substansial.)

Data sebelumnya dari Omicron saat memicu gelombang kelima pandemi di Hong Kong menunjukkan bahwa hingga 4 Mei 2022, terdapat 9.115 kematian dari 1192.765 kasus baru yang dikonfirmasi selama gelombang kelima (angka kematian kasar 0,76%) dan angka kematian kasar 2,70% untuk orang berusia di atas 60 tahun (sekitar 19,30% dari kelompok usia ini tidak divaksinasi).

Sebaliknya, hanya 2% warga Selandia Baru berusia di atas 60 tahun yang tidak divaksinasi, yang sangat berkorelasi dengan tingkat kematian kasar yang rendah sebesar 0,07% untuk epidemi mahkota baru.

Di sisi lain, meski sering dikatakan bahwa Newcastle mungkin menjadi penyakit musiman dan endemik di masa mendatang, ada pakar akademis yang berpandangan berbeda.

Tiga ilmuwan dari Universitas Oxford dan Pusat Penelitian Gabungan Uni Eropa meyakini bahwa tingkat keparahan Omicron yang lebih rendah mungkin hanya kebetulan, dan bahwa evolusi antigenik yang cepat dan berkelanjutan (evolusi antigenik) dapat memunculkan varian baru.

Tidak seperti kemampuan lolos dari kekebalan tubuh dan penularan, yang tunduk pada tekanan evolusi yang kuat, virulensi biasanya hanya merupakan 'produk sampingan' dari evolusi. Virus berevolusi untuk memaksimalkan kemampuannya menyebar, dan ini juga dapat menyebabkan peningkatan virulensi. Misalnya, dengan meningkatkan jumlah virus untuk memfasilitasi penularan, hal itu masih dapat menyebabkan penyakit yang lebih parah.

Tidak hanya itu, virulensi juga akan menyebabkan kerusakan yang sangat terbatas selama penyebaran virus jika gejala yang ditimbulkan oleh virus tersebut muncul terutama di kemudian hari selama infeksi – seperti dalam kasus virus influenza, HIV, dan virus hepatitis C, untuk menyebutkan beberapa di antaranya, yang punya banyak waktu untuk menyebar sebelum menyebabkan konsekuensi yang serius.

Sumber gambar internet

Dalam keadaan seperti itu, mungkin sulit untuk memprediksi tren strain mutan mahkota baru dari virulensi Omicron yang lebih rendah, tetapi kabar baiknya adalah bahwa vaksin mahkota baru telah menunjukkan penurunan risiko penyakit parah dan kematian terhadap semua strain mutan, dan peningkatan agresif tingkat vaksinasi populasi tetap menjadi cara penting untuk memerangi epidemi pada tahap ini.
Ucapan Terima Kasih: Artikel ini telah ditinjau secara profesional oleh Panpan Zhou, PhD, Fakultas Kedokteran Universitas Tsinghua dan Peneliti Pascadoktoral, Scripps Research Institute, AS.
Reagen antigen uji mandiri Omicron di rumah