Seberapa besar penurunan toksisitas Omicron? Berbagai studi dunia nyata mengungkapkan

“Virulensi Omicron mendekati virulensi influenza musiman” dan “Omicron secara signifikan kurang patogenik dibandingkan Delta”. …… Akhir-akhir ini, banyak berita tentang virulensi strain mutan mahkota baru Omicron yang tersebar di internet.

Memang, sejak kemunculan galur mutan Omicron pada November 2021 dan prevalensi globalnya, penelitian dan diskusi tentang virulensi dan penularan terus berlanjut. Bagaimana profil virulensi Omicron saat ini? Apa yang diungkapkan penelitian tentangnya?

Berbagai penelitian laboratorium: Omicron kurang virulen
Faktanya, pada Januari 2022, sebuah studi dari Fakultas Kedokteran Universitas Hong Kong Li Ka Shing menemukan bahwa Omicron (B.1.1.529) mungkin kurang patogenik dibandingkan dengan strain asli dan strain mutan lainnya.
Galur mutan Omicron ditemukan tidak efisien dalam menggunakan protease serin transmembran (TMPRSS2), sementara TMPRSS2 dapat memfasilitasi invasi virus ke sel inang dengan memecah protein spike virus korona baru. Pada saat yang sama, para peneliti mengamati bahwa replikasi Omicron berkurang secara signifikan pada galur sel manusia Calu3 dan Caco2.

Sumber gambar internet

Pada model tikus k18-hACE2, replikasi Omicron berkurang pada saluran pernapasan atas dan bawah tikus dibandingkan dengan strain asli dan mutan Delta, dan patologi paru-parunya tidak terlalu parah, sedangkan infeksi Omicron menyebabkan lebih sedikit kehilangan berat badan dan kematian dibandingkan dengan strain asli dan mutan Alpha, Beta, dan Delta.
Oleh karena itu, para peneliti menyimpulkan bahwa replikasi dan patogenisitas Omicron berkurang pada tikus.

Sumber gambar internet

Pada 16 Mei 2022, Nature menerbitkan sebuah makalah oleh Yoshihiro Kawaoka, seorang ahli virologi terkemuka dari Universitas Tokyo dan Universitas Wisconsin, yang mengonfirmasi untuk pertama kalinya dalam model hewan bahwa Omicron BA.2 memang kurang ganas daripada strain asli sebelumnya.

Para peneliti memilih virus BA.2 hidup yang diisolasi di Jepang untuk menginfeksi tikus dan hamster k18-hACE2 dan menemukan bahwa, setelah infeksi dengan dosis virus yang sama, tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki titer virus yang secara signifikan lebih rendah di paru-paru dan hidung daripada infeksi strain New Crown asli (p<0,0001).

Hasil standar emas ini menegaskan bahwa Omicron memang kurang virulen dibandingkan tipe liar aslinya. Sebaliknya, tidak terdapat perbedaan titer virus yang signifikan di paru-paru dan hidung model hewan setelah infeksi BA.2 dan BA.1.

Sumber gambar internet

Pengujian viral load PCR menunjukkan bahwa tikus yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 memiliki viral load yang lebih rendah di paru-paru dan hidung dibandingkan dengan strain New Crown asli, terutama di paru-paru (p<0,0001).

Mirip dengan hasil pada tikus, titer virus yang terdeteksi di hidung dan paru-paru hamster yang terinfeksi BA.2 dan BA.1 lebih rendah daripada strain asli setelah 'inokulasi' dengan dosis virus yang sama, terutama di paru-paru, dan sedikit lebih rendah di hidung hamster yang terinfeksi BA.2 daripada BA.1 – faktanya, setengah dari hamster yang terinfeksi BA.2 tidak mengalami infeksi paru-paru.

Lebih lanjut ditemukan bahwa strain asli, BA.2 dan BA.1, tidak memiliki netralisasi silang serum setelah infeksi – konsisten dengan apa yang telah diamati pada manusia di dunia nyata ketika terinfeksi dengan mutan mahkota baru yang berbeda.

Sumber gambar internet

Data dunia nyata: Omicron lebih kecil kemungkinannya menyebabkan penyakit serius

Beberapa penelitian di atas telah menjelaskan berkurangnya virulensi Omicron pada model hewan laboratorium, tetapi apakah hal yang sama berlaku di dunia nyata?

Pada tanggal 7 Juni 2022, WHO menerbitkan laporan yang menilai perbedaan tingkat keparahan orang yang terinfeksi selama epidemi Omicron (B.1.1.529) dibandingkan dengan pandemi Delta.

Laporan tersebut mencakup 16.749 pasien rawat inap koroner baru dari seluruh provinsi di Afrika Selatan, termasuk 16.749 pasien dari epidemi Delta (2/8/2021 hingga 3/10/2021) dan 17.693 pasien dari epidemi Omicron (15/11/2021 hingga 16/2/2022). Pasien-pasien tersebut juga diklasifikasikan sebagai pasien berat, serius, dan tidak berat.

kritis: telah menerima ventilasi invasif, atau oksigen dan oksigen transnasal aliran tinggi, atau oksigenasi membran ekstrakorporeal (ECMO), atau masuk ke ICU selama rawat inap.
-parah (berat): menerima oksigen selama dirawat di rumah sakit
-tidak parah: jika tidak ada kondisi di atas yang terpenuhi, pasien termasuk dalam kategori tidak parah.

Data menunjukkan bahwa pada kelompok Delta, 49,2% pasien kritis, 7,7% pasien kritis, dan 28% dari seluruh pasien Delta yang dirawat di rumah sakit meninggal dunia. Sementara itu, pada kelompok Omicron, 28,1% pasien kritis, 3,7% pasien kritis, dan 15% dari seluruh pasien Omicron yang dirawat di rumah sakit meninggal dunia. Selain itu, median lama rawat inap pada kelompok Delta adalah 7 hari, dibandingkan dengan 6 hari pada kelompok Omicron.

Selain itu, laporan tersebut menganalisis faktor-faktor yang memengaruhi yaitu usia, jenis kelamin, status vaksinasi, dan penyakit penyerta, serta menyimpulkan bahwa Omicron (B.1.1.529) dikaitkan dengan kemungkinan lebih rendah terkena penyakit serius dan kritis (95% CI: 0,41 hingga 0,46; p<0,001) dan risiko lebih rendah terkena kematian di rumah sakit (95% CI: 0,59 hingga 0,65; p<0,001).

Sumber gambar internet

Untuk berbagai subtipe Omicron, penelitian lebih lanjut juga telah menganalisis virulensinya secara rinci.

Sebuah studi kohort dari New England menganalisis 20.770 kasus Delta, 52.605 kasus Omicron B.1.1.529, dan 29.840 kasus Omicron BA.2, dan menemukan bahwa proporsi kematian adalah 0,7% untuk Delta, 0,4% untuk B.1.1.529, dan 0,3% untuk BA.2. Setelah disesuaikan dengan faktor perancu, studi ini menyimpulkan bahwa risiko kematian BA.2 secara signifikan lebih rendah dibandingkan dengan Delta dan B.1.1.529.

Sumber gambar internet

Studi lain dari Afrika Selatan menilai risiko rawat inap dan risiko luaran parah untuk Delta, BA.1, BA.2, dan BA.4/BA.5. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 98.710 pasien baru yang terinfeksi dalam analisis, 3.825 (3,9%) dirawat di rumah sakit, dan 1.276 (33,4%) di antaranya mengalami kondisi parah.

Di antara mereka yang terinfeksi berbagai mutasi, 57,7% pasien yang terinfeksi Delta mengalami penyakit parah (97/168), dibandingkan dengan 33,7% pasien yang terinfeksi BA.1 (990/2940), 26,2% pasien yang terinfeksi BA.2 (167/637), dan 27,5% pasien yang terinfeksi BA.4/BA.5 (22/80). Analisis multivariat menunjukkan bahwa probabilitas berkembangnya penyakit serius pada mereka yang terinfeksi Delta > BA.1 > BA.2, sementara probabilitas berkembangnya penyakit serius pada mereka yang terinfeksi BA.4/BA.5 tidak berbeda secara signifikan dibandingkan dengan BA.2.
Virulensi berkurang, namun kewaspadaan tetap diperlukan

Studi laboratorium dan data nyata dari beberapa negara telah menunjukkan bahwa Omicron dan subtipe-nya kurang ganas dan kecil kemungkinannya menyebabkan penyakit serius dibandingkan strain asli dan strain mutan lainnya.

Namun, sebuah artikel ulasan dalam jurnal The Lancet edisi Januari 2022, berjudul 'Milder but not mild', mencatat bahwa meskipun infeksi Omicron menyumbang 21% dari total rawat inap pada populasi Afrika Selatan yang lebih muda, proporsi wabah yang menyebabkan penyakit parah kemungkinan akan meningkat pada populasi dengan tingkat infeksi dan tingkat vaksinasi yang berbeda. (Meskipun demikian, pada populasi Afrika Selatan yang umumnya muda ini, 21% pasien rawat inap yang terinfeksi varian omicron SARS-CoV-2 menunjukkan hasil klinis yang parah, proporsi yang mungkin meningkat dan menyebabkan dampak substansial selama wabah pada populasi dengan demografi yang berbeda dan tingkat kekebalan yang lebih rendah, baik yang berasal dari infeksi maupun yang berasal dari vaksin.)

Di akhir laporan WHO yang disebutkan sebelumnya, tim mencatat bahwa meskipun virulensi strain sebelumnya berkurang, hampir sepertiga pasien Omicron (B.1.1.529) yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah, dan berbagai mutan mahkota baru terus menyebabkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi pada populasi lansia, dengan gangguan kekebalan tubuh, atau yang tidak divaksinasi. (Kami juga ingin mengingatkan bahwa analisis kami tidak boleh dianggap mendukung narasi varian 'ringan'. Hampir sepertiga pasien Omicron yang dirawat di rumah sakit mengalami penyakit parah dan 15% meninggal; angka yang tidak dapat diabaikan……Di antara populasi rentan, yaitu pasien pada usia ekstrem, pada populasi dengan beban komorbiditas tinggi, pada pasien yang lemah, dan di antara yang tidak divaksinasi, COVID-19 (semua VOC) terus berkontribusi terhadap morbiditas dan mortalitas yang substansial.)

Data sebelumnya dari Omicron ketika memicu gelombang kelima pandemi di Hong Kong menunjukkan bahwa per 4 Mei 2022, terdapat 9.115 kematian dari 1192.765 kasus baru yang dites selama gelombang kelima (angka kematian kasar 0,76%) dan angka kematian kasar 2,70% untuk orang berusia di atas 60 tahun (sekitar 19,30% dari kelompok usia ini belum divaksinasi).

Sebaliknya, hanya 2% warga Selandia Baru berusia di atas 60 tahun yang tidak divaksinasi, yang sangat berkorelasi dengan tingkat kematian kasar yang rendah sebesar 0,07% untuk epidemi mahkota baru.

Di sisi lain, meski sering dikatakan bahwa Newcastle mungkin menjadi penyakit endemik musiman di masa mendatang, ada pakar akademis yang memiliki pandangan berbeda.

Tiga ilmuwan dari Universitas Oxford dan Pusat Penelitian Gabungan Uni Eropa meyakini bahwa tingkat keparahan Omicron yang lebih rendah mungkin hanya kebetulan, dan bahwa evolusi antigenik cepat yang berkelanjutan (evolusi antigenik) dapat memunculkan varian baru.

Berbeda dengan kemampuan lolos dari kekebalan dan penularan, yang dipengaruhi oleh tekanan evolusi yang kuat, virulensi biasanya hanyalah 'produk sampingan' evolusi. Virus berevolusi untuk memaksimalkan kemampuannya menyebar, dan hal ini juga dapat menyebabkan peningkatan virulensi. Misalnya, dengan meningkatkan viral load untuk memfasilitasi penularan, hal ini tetap dapat menyebabkan penyakit yang lebih parah.

Tidak hanya itu, virulensi juga akan menyebabkan kerusakan yang sangat terbatas selama penyebaran virus jika gejala yang ditimbulkan oleh virus tersebut muncul terutama di tahap akhir infeksi – seperti pada kasus virus influenza, HIV, dan virus hepatitis C, untuk menyebutkan beberapa di antaranya, yang memiliki cukup waktu untuk menyebar sebelum menyebabkan konsekuensi serius.

Sumber gambar internet

Dalam keadaan seperti itu, mungkin sulit untuk memprediksi tren strain mutan mahkota baru dari virulensi Omicron yang lebih rendah, tetapi kabar baiknya adalah bahwa vaksin mahkota baru telah menunjukkan penurunan risiko penyakit parah dan kematian terhadap semua strain mutan, dan peningkatan agresif tingkat vaksinasi populasi tetap menjadi cara penting untuk memerangi epidemi pada tahap ini.
Ucapan Terima Kasih: Artikel ini telah diulas secara profesional oleh Panpan Zhou, PhD, Fakultas Kedokteran Universitas Tsinghua dan Peneliti Pascadoktoral, Scripps Research Institute, AS.
Reagen antigen uji mandiri Omicron di rumah